学校始创于1948年的中国人民解放军华东野战军第一后方医院卫生学校。2006年，重庆市药剂学校、重庆市卫生学校、重庆市第二卫生学校合并成立重庆医药高等专科学校。　　

　　学校现有大学城、沙坪坝和九龙坡3个校区。　　

　　2022年发明专利授权列全国高职医药类院校第1，当年科研定级被评为A+。

　　学校现有直属附属及共管、共建医院及教学医院20所，其中附属一院为三甲综合医院。

　　学校开设有药学、临床医学、口腔医学、预防医学、护理、医学检验技术、中医学等25个专业。学校医药卫生大类专业竞争力在高职院校评估位居全国第一，DI高职专科专业评估榜（2023），学校获评A+档专业5个，A档专业11个，排名全国医药类高职院校第一。

　　学校面向全国招生，现有全日制在校学生17000余人。多年来，学校录取分数稳居重庆市高职高专最高，录取新生中有超过60%在本科线以上。在中国教育在线高职高专报考热度调查中连续3年全国排名前10。

　　近年来，张德江、刘延东等党和国家领导人先后视察学校，充分了学校的办学水平。

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